如何做pcoa图

2024-10-22 16:26:30

1、PCoA的作图主要分为三个步骤:选择特定的相似性距离并计算距离矩阵。距离的选择可以有Bray-curits、Unifrac等,不同的距离有不同的作用和意义(具体可以参考 微生物β多样性常用计算方法比较)。

如何做pcoa图

3、PCoA图形展示。图形可以用ordiplot()命令展示,但如果需要比较美观的图形,建议用ggplot来画。

如何做pcoa图

5、Group <- c('a'挢旗扦渌;,'b','c')="">#按照目的输入样本shape <- c('a'="16,'B'" =17,'c'="16)">#定义点形状color <- c('a'='#CCFF33' ,'b'='#CCFF33' ,'c'='#CCFF33' )="">#定义点颜色PCOA <- pcoa(du,="" correction='none' ,="" rn="NULL)">#利用PCOA()指令做pcoa分析

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